Spaltenbreite, drei bis neun Zeilen hohe, ungerahmte Zeichnungen zwischen dem Text, am Kopf oder am Fuß des Blattes, zuweilen über den Schriftspiegel hinausragend, darüber Kapitelüberschrift in der Funktion einer Bildbeischrift; 83^va am linken Seitenrand querstehend (für die Illustration vorgesehener Leerraum fehlt). Leerräume 244^rb–275^vb (III D–F) nur zwei- bis vierzeilig.

Sehr lebendige Strichführung aus kurzen, mehrfach angesetzten, etwas zittrigen Federlinien und kurzen Pinselschraffen und -tupfen. Modellierung durch verlaufenden Farbauftrag sowie Parallel- und Kreuzschraffen in Feder und dünnem Pinsel. Flaches Bodenstück aus lavierter Farbfläche, mit kurzen, senkrechten und gekreuzten Pinsel- und Federschraffen und Farbtupfen übergangen, Himmel nicht koloriert. Baumkronen meist aus Farbtupfen oder kurzen, waagrechten Pinselstrichen gebildet. Gedrungene, rundköpfige, halslose Figuren in anatomisch korrekter Körperhaltung und -bewegung. Die Tiere in Teil III A sitzen, stehen oder bewegen sich bildbeherrschend auf dem mitunter durch Bäume oder Architekturen bestandenen Bodenstück oder in einer Gebirgslandschaft auf zackigen, knittrigen Felsen (so z. B. 69^ra kletternde Gemsen). Zuweilen auch Genreszenen (67^vb Hofhund verjagt Dieb, 78^va Grabtier auf offenem Grab steigend, im Hintergrund Kirche; die Ziege 69^rb mit den Scheider-Attributen Wollknäuel und Schere). Höchst qualitätvolle, »naturalistische« und anatomisch äußerst genaue Darstellung der Tiere. Originelle Bilderfindungen im Teil I: Sitzende oder stehende Personen oder Personengruppen zeigen entweder den im illustrierten Kapitel besprochenen Körperteil (z. B. 6^ra Mann streckt Zunge heraus) oder illustrieren das Thema mit einer Genreszene (z. B. 4^ra Ohren: auf einer Wiese tanzender Mann, mit einer Hand eine Flöte blasend, in der anderen eine Schelle; 5^va Zähne: ein Bader zieht einem sitzenden Mann, den eine zweite Person festhält, einen Zahn; 6^rb Stimme: eine Frau und zwei Männer, unter einem Baum sitzend, singen aus einem Liederbuch). Zahlreiche Darstellungen einzelner, stets aus einem Bodenstück wachsender oder darauf liegender Körperteile (z. B. 9^va Fingernägel: zwei aus einer Rasenfläche wachsende, halbe Hände; 10^ra Beine: zwei am Boden liegende, abgetrennte Beine). Zur Verbildlichung innerer Organe oft symbolische Darstellungen, so z. B. für die Luftröhre (I,17) ein Blasebalg (7^vb), für das Gaumenzäpfchen (I,15) ein Dudelsack (7^rb), für das mäuslein (I,22) eine Katze, die eine Maus am Schwanz packt (8^vb). Die Illustrationen zu III A 21 und 22 (Duran und Dachs) sind in eine Darstellungseinheit integriert: beide Tiere, von einem Hund verbellt, in einer Gebirgslandschaft (72^vab).

Bis auf 26^ra (Sphärenschema als Titelbild zu Teil II) nur Kapitelillustrationen, davon ausgeführt 24 zu Teil I (1^rb–19^rb) und 54 zu Teil III A (64^rb–89^ra) sowie 22 Leerräume zu Teil II (27^ra–56^rb), 66 zu III B (89^rb–133^ra), 63 zu IV (134^rb–179^rb), 89 zu V (182^rb–216^va), neun zu III D (244^rb–252^rb), 24 zu III E (254^rb–270^rb) und fünf zu III F (271^rb–275^vb); keine Leerräume zu VI–VIII.

Die Handschrift ist v. a. wegen der höchst originellen und phantasievollen ikonographischen Erfindungen zu Teil I bemerkenswert: In keinem anderen Megenberg-Codex sind die Kapitel über menschliche Körperteile und Organe so ausführlich, detail- und einfallsreich illustriert worden. Auch mit ihren realitätsnahen, die Anatomie und die Bewegungsabläufe der Tiere äußerst natürlich und gekonnt wiedergebenden Illustrationen zum Teil III A überragt das Manuskript alle anderen Bilderhandschriften des Texts.

Helles Grün, Blau, Hell- und Dunkelbraun, Ocker, Gelb, Grau, Rot.