Die Schwesterhandschriften wurden sehr ähnlich konzipiert und ausgeführt, so dass man davon ausgehen kann, dass es eine gemeinsame Vorlage gegeben hat. Der Bildteil der Erlanger Handschrift ist umfangreicher, zudem besitzt sie einen separierten Teil 151^r–185^r, der die Bildtafeln im Fließtext erklärt.

Das Werk besitzt eine visuell einheitliche Grundstruktur, trotz der denkbar unterschiedlichen Themen, die es zusammenführt.

An den unfertigen Bildseiten (116^v) kann nachvollzogen werden, dass zunächst der rechteckige Bildraum angelegt wurde, der nahezu die gesamte Seite einnimmt und in unterschiedlichsten Farben koloriert und getuscht ist. Auf mehreren Seiten schimmert der Hintergrund kupferfarben (z. T. korrodiert): 1^r, 2^r, 3^r (eventuell noch auf der Doppelseite 43^v–44^r, wegen der Anfälligkeit der Technik ist hier ein sehr verschwommener Hintergrund zu sehen). Der Auftrag von Kupferfarbe ist immer nur auf einer Seite möglich und offenbar so aufwändig, dass er schnell wieder aufgegeben wurde und nur noch einmal (112^r) wieder auftaucht (vielleicht in Entsprechung zur Farbigkeit der Edelsteine, von denen hier die Rede ist). Nach dem Bildraum wurde das Grundgerüst der Binnendarstellung festgelegt, die sich immer zentral innerhalb des Bildraums befindet und häufig als Rundbild gestaltet ist. Viele Schemata auf den Blättern 14^r–53^v wurden mit beweglichen Elementen (Pfeile, Drehscheiben) ausgestattet (19^r, 21^r, 31^r), z. T. sind mehrere Scheiben übereinander angebracht. Innerhalb der Rundbilder, Schemata, Tabellen finden sich häufig Beischriften in unterschiedlicher Farbe, dazu Goldapplikationen für Sterne und kleine, dekorative Punkte, auch Lackfarbe wurde verwendet (54^v). Seiten unterschiedlichster Themen weisen Naturselbstdrucke von Kräutern und Pflanzen auf. Manchmal sind spätere Zusatzzeichnungen von anderer Hand zu sehen (z. B. Seeungeheuer 7^v, unten 86^v).

Der Text wurde immer zuletzt eingefügt, oft bleibt das Zeilengerüst im Bildraum auch einfach leer. Die Handschrift wurde für dieses Verweissystem von Anfang an foliiert. Um die Auffindbarkeit der gewünschten Textstellen zusätzlich zu erleichtern, sind im schwarzen Fließtext Stichworte oder ganze Zeilen in verschiedenfarbiger Auszeichnungsschrift hervorgehoben oder zumindest mit Rot unterstrichen. Bild- und Textteil müssen demnach gemeinsam konzipiert worden sein.

Die komplizierte Konzeption der Handschrift bereitete schon zur Zeit der Entstehung kleinere Schwierigkeiten: Die Foliierung war zum Teil fehlerhaft, so dass Rughalm sich mit Ersatzzählungen behelfen musste (38a–m); zwei Weltwunder fehlen in Abschnitt 10^v–13^v und kommen unvermittelt in einem späteren Bildabschnitt (113^r, 114^r) vor; es kam zu Abschreibfehlern (in der Temperamentenlehre 38^v sind Sommer und Frühling vertauscht, der Text auf 100^v bricht einfach ab); die Darstellung ›Mann mit seinem bösem Weib‹ (125^r) ist (wohl durch mehrere Zwischenschritte in ihrer Überlieferung) so stark verunklärt, dass man nur anhand der Krakauer Handschrift (95^v) auf das Bildthema schließen kann.

Die Bildvorlagen stammen häufig aus der Druckgraphik. Die Erlanger Handschrift hat etwas aktuellere Vorlagen verwendet als die Krakauer Schwesterhandschrift, was bestätigt, dass sie später als diese abgeschlossen wurde. Im Allgemeinen wurden die Holzschnitte nicht exakt kopiert, sondern variiert und häufig in Rundbilder umgeformt. Dabei orientiert sich Erlangen, MS.B 200 sehr viel genauer an den graphischen Vorlagen als die Krakauer Handschrift.

Identifizierbar sind v. a. folgende Vorlagen
– Hartmann Schedel, ›Liber chronicarum‹ (Nürnberg: Anton Koberger für Sebald Schreyer und Sebastian Kammermeister, 1493; GW M40784): für Schöpfungswerk und wundersame Erdbewohner (1^r–7^v), eventuell Arche Noah (9^v–10^r).
– Johannes Regiomontanus, ›Kalender‹ ([Nürnberg: Hans Sporer, ca. 1474–1476]; Blockbuch (vgl. München, Staatsbibliothek, Xylogr. 45): eventuell für 38b^v–38c^r, 38d^v.
– Johannes Sacroboscos ›Sphaera mundi‹ und ›Opus sphaericum‹ (z. B. Leipzig: Konrad Kachelofen, [1489]; GW M14579): für astronomisch-astrologische Darstellungen und geometrische Elemente.
– Johannes Stabius, Horoskop für Kaiser Maximilian I. ›Horoscopion omni generaliter congruens climati‹ (Nürnberg: Hieronymus Höltzel, 1512; Einblattdruck; New Hollstein 75 [2010] Nr. 128–130): für 34^v.
– Johannes Stabius, ›Figura Labyrinthi‹ ([Nürnberg: Wolfgang Huber, ca. 1504]; VD16 S 8415): für 109^v–110^v (der erklärende Text zu den Labyrinthen [172] ist nicht die deutsche Übersetzung des lateinischen Stabius-Textes).
– Bernhard von Breidenbach, ›Peregrinatio in terram sanctam‹ (Erstdruck Mainz: Erhard Reuwich, 1486 [GW 5075]), 132^v: für Tiere auf 89^v (hec animalia sunt veraciter depicta sicut vidibus in terra sancta).
– Hieronymus Brunschwig, ›Buch der Cirurgia‹ (Erstdruck: Straßburg: Johannes Grüninger, 1497 [GW 5593]), XIX^r: für chirurgische Geräte, nun auf mehrere Seiten verteilt: 73^v–75^r.
– Petrus de Tossignano, ›Fasciculus medicinae‹ (Venedig: Johannes und Gregorius de Gregoriis, 1500 [GW M14181]): für Darstellungen zur Anatomie und Krankheiten bei einer Frau (77^r und 77^v), evtl. für 63^v (Blutschau) und 76^v (Urinschau), darüber hinaus vielleicht für 64^r–65^v (Aderlassmann, Krankheitsmann, Wundenmann).
– Eucharius Rößlin, ›Der schwangeren Frauen und Hebammen Rosengarten‹ (Erstdruck Straßburg: Martin Flach, 1513 [VD16 R 2848]): für Kindslagenbilder und Geburtsstuhl (78^r–79^r); vgl. Kiepe [1984] S. 373.
– Hans von Gerdorff, ›Feldbuch der Wundartzney‹ (Straßburg: Johannes Schott, 1517 [VD16 G 1618]): für den Text 158^r–161^r (Von dem feltbúech … Namen der kreitter …) und für die Darstellungen chirurgischer Instrumente und Behandlungen, Amputationen etc.
– Petrus Apian, ›Cosmographia‹ (Landshut: Peter Apian und Johann Weißenburger, 1524 [VD16 A 3080]): u. a. für 30^r (nach Apians Titelblatt), 31^v–32^v (nach Apian, XIIII^r –XV^v), 29^r (III^v), 32^v (XVI^v und XVI^v).

Die Bilderhandschrift besteht aus einer Aneinanderreihung an Themen, die sich als enzyklopädisch (Weltwunder, medizinisches und astronomisches Wissen) gemischt mit ›alltäglichem‹ Inhalt (Pferdemundstücke, Fechten und Ringen) beschreiben lassen (siehe oben: Inhalt). Auffällig ist, dass die Darstellungen im Gegensatz zur Krakauer Handschrift immer stärker aus dem Grundschema der Rundbilder ausbrechen und zwar zugunsten von Aneinanderreihungen von Bildern auf einem Blatt. Es wird Vollständigkeit angestrebt, d. h. es werden möglichst vollständig und realistisch alle chirurgischen Instrumente gezeigt, alle chirurgischen Operationen, alle Musikinstrumente, alle Tiere etc., wo in der Krakauer Schwesternhandschrift noch ein Bild für viele weitere steht.

Die mit Hilfe von Zirkeln angebrachten Kreise verweisen auf eine kosmische, göttliche Weltordnung, die traditionell mit Hilfe von Rundbildern veranschaulicht wurde. Die Möglichkeit der Vermessung von Gesichtern oder geometrischen Körpern, das Beherrschen der Jahres- und Tageszeiten, das Verstehen eines mathematisch architektonischen Aufbaus sowie das Erkennen des kosmischen Einflusses auf den Menschen werden in dieser Handschrift verhandelt (64^r wie vndt wo dy 12 zaichen an dem menschen ire wúrckúng haben). Bild und Text verweisen darauf, dass der Mensch dem Kosmos nicht ausgeliefert ist, sondern sein Handeln nach den erkannten Strukturen ausrichten und eventuell verändernd eingreifen kann (wenn nötig chirurgisches Eingreifen: 67^v–72a^r; oder: 54^r einen unsinigen oder ain besessen zu erkenen und helfen, 117^r ein guet roß zu erkennen vndt mengl oder krankhaiten ains haben mag).

Weiß, Gelb, Rosa, Rot, Violett, Blau, Grün, Braun, Grau, Schwarz, selten goldene und kupferfarbene Elemente.